中医同样具有当今现代系统科学的基本特征如整体性、联系性、自组织、动态性、有序性。中医是一门复杂系统生成演化科学。即中医虽然包含现代系统论思想，但超越现代系统论。中医的博大精深思想非现代系统科学所能包含。如天人合一的中医，其观点超越现代医学天人分离医学；中医精气学说是世界本原的一元论，阴阳学说是对世界本原持二元论的学说，五行学说是认识世界本原的一种多元论；是其它医学无法比拟的。中医的思想观念和理论体系是一门潜科学、超科学、未来科学。